Base64 convierte cualquier dato en texto usando solo letras, números, + y /. A veces termina en = o ==, y eso casi siempre lo delata.
Nuestra herramienta codecs.py está en /challenge/codecs.py, y decodifica Base64 con b64d:
hacker@dojo:~$ python3 /challenge/codecs.py b64d "dGV4dG8="
Para pasarle el contenido de un archivo en vez de escribirlo a mano, usa "$(cat archivo)".
Decodifica ~/flag con b64d para encontrar la flag.